Gerda appartient à une famille danoise d’origine française. Elle effectue sa formation artistique à l’Académie Royale des Arts de Copenhague, puis épouse l’artiste Einar Wegener en 1904. Après un voyage en Europe, elle s’installe à Paris où le succès rapide lui ouvre les portes du grand monde : elle brosse les portraits de ses amis bourgeois et artistes, œuvres qui témoignent de la sophistication de la vie parisienne des années 1920-30. Son époux ayant subi la première opération pour devenir une transsexuelle, son mariage est invalidé. Elle épouse un militaire italien, aviateur et diplomate, qu’elle suit au Maroc. Après son divorce, elle retourne au Danemark où elle meurt seule.
Femme émancipée, artiste résolue et travailleuse, Wegener a de multiples talents : peintre reconnue pour ses portraits et ses scènes de genre, dessinatrice et illustratrice internationalement célèbre. Elle illustre des livres de contes et vend ses dessins à divers magazines –Vogue, la Vie parisienne, Fantasio- ; elle exécute également des illustrations érotiques, inspirées par les thèmes récurrents de l’Art Déco. Wegener est consciente de vivre une période de décadence et revendique l’épanouissement que lui procurent son œuvre et sa vie ; l’artiste est maîtresse du jeu.
Elle expose aux Salons d’automne, aux Salons des Indépendants à Paris et régulièrement au Danemark.